Когда-то давно, в древнем Египте, мутант по имени Эн Сабах Нур, известный как Апокалипсис, был первым и самым могущественным представителем своего вида. Он обладал способностью накапливать силу других мутантов и передавать своё сознание в новые тела, что позволяло ему жить тысячелетиями. В двадцатом веке его находят и пробуждают в 1983 году, и он приходит в ярость, увидев, как мир изменился и как мутанты, по его мнению, ослабли и подчинились людям. Он решает очистить планету от слабых и построить новый порядок, где будут править сильнейшие.
Апокалипсис собирает команду из четырёх всадников: Шторм, которую он освобождает от её ограничений, Псайлок, Ангела и Магнето, который переживает личную трагедию и поддаётся гневу. Вместе они начинают сеять хаос по всему миру, уничтожая крупнейшие города и демонстрируя свою мощь. Тем временем, профессор Чарльз Ксавьер, который уже не так молод, пытается найти способ остановить древнего мутанта. Его ученики, включая Джан Грей, Циклопа, Ночного Змея и Джин, начинают раскрывать свои скрытые способности, особенно после того, как Апокалипсис похищает профессора, чтобы использовать его телепатические силы для захвата всех ядерных арсеналов мира.
В решающей битве в Каире, молодые мутанты объединяются с теми, кто остался верен идеям Ксавьера, включая Рейвен и Хэнка. Они противостоят Апокалипсису и его всадникам, используя свои силы и тактику. Джан Грей, пробуждая в себе силу Феникса, становится ключом к победе, уничтожая Апокалипсиса, но при этом жертвуя своей жизнью, чтобы спасти всех. После битвы, Ксавьер, осознавая, что его время уходит, готовит новое поколение мутантов к будущим испытаниям, а Магнето, осознав свою ошибку, уходит, чтобы скрыться от мира, но оставляет надежду на возможное примирение.
